Havdrup station er en af de oprindelige stationer på Sydbanen (fra ca. 1924 Lille syd). Stationsbygningen fremstår i sit ydre stort set som i 1870, dog forlænget med et sydligt fag.
Havdrup station blev som de øvrige oprindelige stationer på Sydbanen blev opført under ledelse af arkitekt Charles Abrahams (eller Chr. Abrahams).
Oprindeligt eneste station mellem Roskilde og Køge. Fra ca. 1908 beliggende mellem Gadstrup og Lille Skensved.
Stationen havde fra ca. 1908 et Siemens & Halske mekanisk sikringsanlæg, der i 1985 blev udskiftet med et sikringsanlæg DSB type 1977 og der indførtes fjernstyring fra FC Roskilde. Anlæggene var - som i Tureby og Haslev - placeret i en karnap på stationsbygningen.
Sidespor og læsevej lå syd for stationsbygningen på samme side af hovedsporene som denne. I dag er sporanlægget reduceret til de to togvejsspor. I stationens nordende krydses perronsporene i overkørsel 86 diagonalt af hovedgade i Havdrup.
Stationsforstandere
- H.P. Johansen 1870-1879
- W. Müllertz 1/10-1879 - 30/11 1880
- J-P. Dorph 1/12-1880 - 30/11 1885
- H.H. Appel 1/1-1886 - 14/4 1892
- P.E. Erichsen 1/5 1892 - 31/3 1900
- A.T. Thorbjørnsen 1/5 -1900 - 30/6 1901
- C.V.T. Madsen 1/7 -1901 - 30/11 1906
- H.C. Knauer 1/1 1907 8/1 1919
- M. Aasted /4 1919 - 30/4 1934
- H.M.C. Hener 1/5 1934 - 31/7 1939
- N.P.N. Nordestedgaard 1/9 1939 - 30/4 1951
- L.E. Nielsen 1/5 1951 - 19/8 1953
- P. Pind 1/11 1953 - 30/9 1967 (sidste stationsforstander)
- Johannes Jørgensen (stationsmester) dato kendes ikke - stoppet ca. 1984