Snekkersten station Sq blev etableret som trinbræt på Nordbanen (1864) i 1879.
Snekkersten fik ny station i 1892 i forbindelse med omlægning af nordbanens tracé fra Rørtang til Helsingør og den i 1891 gennemførte flytning af Helsingør station fra trækbanen til en nybygget station ved havnen.
Den nuværende stationsbygning er fra 1956 (wikipedia 1954), tegnet af Sigurd Christensen.