Fjenneslev station etableredes i 1887 sammen med Kværkeby og Frederikslund stationer - uden passagerekspedition - for at optimere krydsningsmulighederne på den enkeltsporede Vestbane (Roskilde-Korsør).
I 1893 blev hovedbygningen fra 1887 udvidet og ca. 1910 blev der bygget en ny hovedbygning i forbindelse med den gamle.
Nedlagt for passagertrafik 27. maj 1962