Han blev i 1993 cand.oecon. fra Odense Universitet (I dag Syddansk Universitet).
De følgende år arbejdede Søren Eriksen henholdsvis som økonom i Tele Danmark, økonomichef i Tele Danmark Forsyning, Økonomidirektør i Tele Danmark og økonomidirektør i TDC Tele Danmark A/S.
I 2002 blev han koncerndirektør i DSB, hvor han i 2006 blev konstitueret som administrerende direktør efter forgængeren, Keld Sengeløvs, pludselige død. Fra marts 2007 blev han udnævnt til øverste chef for de godt 10.000 ansatte i statsbanerne.
Hans kone er ifølge Ritzau landskabsarkitekt, og parret har to børn